Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Top1mtQ8R4U6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Top1mtQ8R4U6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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