Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stn1Q8K2X3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms