Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mtmr3Q8K296 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mtmr3Q8K296 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mtmr3Q8K296 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mtmr3Q8K296 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms