Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pkn3Q8K045 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms