Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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