Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pramef8Q8CE24 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pramef8Q8CE24 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms