Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ubqln3Q8C5U9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms