Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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