Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8BGC1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8BGC1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms