Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NischQ80TM9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
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