Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ube2q1Q7TSS2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ube2q1Q7TSS2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms