Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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