Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Uhrf2Q7TMI3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Uhrf2Q7TMI3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms