Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vma21Q78T54 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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