Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmed3Q78IS1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tmed3Q78IS1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Tmed3Q78IS1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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