Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

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Length 1,607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Thsd7bQ6P4U0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thsd7bQ6P4U0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thsd7bQ6P4U0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thsd7bQ6P4U0 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thsd7bQ6P4U0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Thsd7bQ6P4U0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Thsd7bQ6P4U0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd7bQ6P4U0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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