Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Krt39Q6IFX4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Krt39Q6IFX4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Krt39Q6IFX4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt39Q6IFX4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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