Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt40Q6IFX3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms