Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms