Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Ss18Q62280 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms