Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RhocQ62159 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RhocQ62159 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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