Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Samhd1Q60710 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms