Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sin3aQ60520 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms