Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms