Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Znf608Q56A10 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Znf608Q56A10 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Znf608Q56A10 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Znf608Q56A10 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf608Q56A10 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms