Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spire1Q52KF3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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