Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms