Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Smim9Q3V0X1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Smim9Q3V0X1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smim9Q3V0X1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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