Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D13Ertd608eQ3UPR8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms