Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms