Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gpr55Q3UJF0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms