Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Zswim8Q3UHH1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zswim8Q3UHH1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms