Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Puf60Q3UEB3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms