Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trafd1Q3UDK1 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trafd1Q3UDK1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms