Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gse1Q3U3C9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms