Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccndbp1Q3TVC7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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