Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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