Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms