Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fam107bQ3TGF2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fam107bQ3TGF2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms