Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Shroom4Q1W617 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Shroom4Q1W617 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms