Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc162pQ0VG85 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc162pQ0VG85 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc162pQ0VG85 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc162pQ0VG85 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc162pQ0VG85 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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