Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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Lrriq1Q0P5X1 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrriq1Q0P5X1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms