Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ubxn2bQ0KL01 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubxn2bQ0KL01 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms