Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
MitfQ08874 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
MitfQ08874 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms