Protein–RNA interactions for Protein: Q03288

Asip, Agouti-signaling protein, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AsipQ03288 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AsipQ03288 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
AsipQ03288 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms