Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
GscQ02591 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
GscQ02591 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
GscQ02591 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
GscQ02591 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
GscQ02591 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms