Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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F8a1Q00558 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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F8a1Q00558 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
F8a1Q00558 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms