Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Shc1P98083 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms