Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pitx2P97474 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms