Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf1bP97358 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Taf1bP97358 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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